RT-MLPSEQ: een nieuwe technologie om kankers te karakteriseren Genexpressie en fusietranscripten
RT-MLPSeq Aangepaste Oplossing
In onderzoeksprojecten, preklinische en klinische studies is het vaak noodzakelijk om de genexpressie of de aanwezigheid van fusietranscripten van tientallen markers te bepalen. Momenteel kunnen relatieve expressie en fusietranscripten alleen gelijktijdig worden geanalyseerd voor een klein aantal genen, met behulp van complexe protocollen. Bovendien zijn de verwerkingstijden vaak erg lang en zijn de oplossingen op de markt vaak duur.
Aangepast Panel van Genexpath
De aangepaste panel-oplossing van Genexpath stelt u in staat om snel en eenvoudig uw markers van belang te selecteren. Wij bieden u vervolgens een kant-en-klare oplossing: een in vitro-test en een bio-informatische analyse na NGS-sequencing.
Deze aangepaste panels kunnen worden geproduceerd voor elk type genoom. Wij staan tot uw beschikking om panels te maken met tien tot honderd markers.
Voordelen van RT-MLPSEQ:
-
Eenvoudig en snel protocol: Halve dag manipulaties.
-
Kleine hoeveelheid materiaal vereist: Slechts 50–500 ng RNA nodig. Compatibel met verse, bevroren of FFPE-monsters (weefsel, vloeistof, enz.). Geoptimaliseerd voor moeilijke monsters zoals FFPE.
-
Geen zuivering vereist: Beperkt materiaalverlies en zorgt voor uitstekende gevoeligheid.
-
Robuustheid van de techniek.
Toepassingen in Oncologiediagnostiek
De RT-MLPSeq-technologie wordt al gebruikt in oncologische diagnosepakketten voor:
-
Karakterisering van niet-Hodgkin-lymfomen: Volgens de WHO-classificatie, door nauwkeurige meting van de expressiesignatuur van meer dan 130 genen met onze LymphoSign-test (CE-IVD).
-
Karakterisering van perifere T-cellymfomen: Door analyse van fusietranscripten met onze LymphoTranscript-test.
-
Karakterisering van sarcomen: Door analyse van meer dan 140 fusietranscripten met onze SarcomaFusion-test (CE-IVD).
RT-MLPSEQ: Een eenvoudig en snel protocol
-
De in vitro-test bestaat uit 4 stappen die een halve dag duren, inclusief 1–1,5 uur verwerkingstijd.
-
NGS-sequencing vereist slechts 100.000 reads per monster.
-
Monsters kunnen samen met andere bibliotheken worden gesequenced, en barcodes zijn inbegrepen in de kit.
-
Deze tests besparen aanzienlijke tijd in uw projecten.
Robuuste en efficiënte computeranalyse
Zodra de sequencing is voltooid, kunt u het FASTQ-bestand uploaden naar het Genexpath-platform. Binnen enkele minuten ontvangt u een bestand met ruwe gegevens en de relatieve expressie van elke marker.
Op verzoek kan RT-MIS ook aangepaste grafieken genereren om de interpretatie van de resultaten te vergemakkelijken.
Aangepaste panels zijn beschikbaar voor 32 of 64 monsters.
Alleen voor onderzoeksdoeleinden
|
Neem contact op met ons technische ondersteuningsteam om te ontdekken hoe wij u kunnen helpen. |