O cDNA de rato (DNA complementar) é uma cópia de DNA de moléculas de RNA derivadas de amostras biológicas de Rattus norvegicus e geradas por transcrição reversa. Como o cDNA é derivado do RNA e não do DNA genómico, fornece informação de sequência correspondente aos transcritos presentes na amostra inicial, incluindo regiões codificantes de transcritos codificantes de proteínas e sequências de RNAs não codificantes. O cDNA é amplamente utilizado em biologia molecular para apoiar a análise de expressão génica, a caracterização de transcritos, o sequenciamento e a clonagem.

Os estudos do transcriptoma de rato identificaram uma substancial diversidade de transcritos associada a tecidos e processamento alternativo de RNA, apoiando o uso de recursos de cDNA de rato para investigação de transcritos e genómica funcional. No entanto, a representação do cDNA pode ser influenciada pelo input de RNA, pela seleção de primers, pela atividade da transcriptase reversa e por outros fatores experimentais, pelo que não deve ser considerada uma representação quantitativa exacta da população de RNA original.

Características principais

• Sequência específica de rato : Derivada de RNA de Rattus norvegicus para estudos moleculares específicos da espécie.

• Representação de transcritos : Fornece cópias de DNA de sequências derivadas de RNA e pode apoiar a análise da estrutura de transcritos, variantes de splicing e diversidade de transcritos.

• Compatibilidade com biologia molecular : Aplicável à amplificação por PCR, sequenciamento, clonagem e outros fluxos de trabalho baseados em DNA.

• Acesso a sequências codificantes : Pode fornecer sequências de regiões codificantes de transcritos codificantes de proteínas para estudos moleculares e funcionais posteriores.

Usos habituais de investigação

• Análise de expressão génica : O cDNA é comumente utilizado como molde para RT-qPCR e fluxos de trabalho relacionados de quantificação de transcritos.

• Análise de transcritos e isoformas : Apoia a investigação da estrutura de transcritos, splicing alternativo e diversidade de transcritos.

• Clonagem e expressão génica : Permite o isolamento ou a clonagem de sequências codificantes para caracterização funcional e estudos de expressão proteica heteróloga.

• Sequenciamento e transcriptómica : O cDNA é utilizado como intermediário em muitos fluxos de trabalho de preparação de bibliotecas de RNA-seq e transcriptoma, embora algumas abordagens de sequenciamento utilizem o sequenciamento direto de RNA.