As amígdalas, conjuntos de órgãos linfóides orientados para o trato digestivo, são a primeira defesa do sistema imunológico contra patógenos externos e ajudam a prevenir infecções respiratórias e gastrointestinais. As amígdalas incluem a amígdala faríngea, duas amígdalas tubárias, duas amígdalas palatinas e as amígdalas linguais. As amígdalas têm células especializadas na captura de antígenos em sua superfície, chamadas células M, que ajudam a absorver antígenos produzidos pelos patógenos. Essas células M então alertam as células B e T subjacentes na amígdala sobre a presença de um patógeno e uma resposta imune é estimulada. As células endoteliais, as células epiteliais e os fibroblastos são componentes essenciais necessários para o funcionamento normal do sistema das amígdalas. Mudanças na proliferação celular e na regulação dentro do sistema das amígdalas levam ao desenvolvimento de amigdalite e hiperplasia adenoamigdalar.