Muizen-cDNA (complementair DNA) wordt gegenereerd door reverse transcriptie van RNA verkregen uit weefsels, cellen of andere biologische monsters van Mus musculus. Het biedt een DNA-representatie van de RNA-moleculen die aanwezig zijn in de uitgangs-RNA-preparatie en wordt veel gebruikt om genexpressie van de muis, transcriptsequenties, transcriptisovormen en genfunctie te bestuderen. Grootschalige projecten met volledige muizen-cDNA’s hebben een uitgebreide transcript-diversiteit en weefsel- en ontwikkelingsstadium-afhankelijke expressiepatronen onthuld, waardoor cDNA-collecties belangrijke bronnen zijn geworden voor transcript- en functionele genoomonderzoek.

Belangrijkste kenmerken

• Muisspecifieke oorsprong : Afgeleid van RNA-bronnen van Mus musculus voor soortspecifieke moleculaire studies.

• Transcriptrepresentatie : Vertegenwoordigt de RNA-moleculen die aanwezig zijn in het bronmateriaal en kan coderende transcripten, niet-getransleerde regio’s en transcriptisovormen omvatten, afhankelijk van de RNA-bron en de cDNA-preparatie.

• Materiaal in DNA-formaat : cDNA kan worden geamplificeerd, gesequenced, gekloneerd of geanalyseerd met standaard moleculairbiologische methoden.

Gebruikelijke onderzoeksgebruiken

• PCR en qPCR : Wordt gebruikt als template voor amplificatie en kwantificatie van specifieke transcripten.

• Transcriptidentificatie en sequencing : Ondersteunt de karakterisering en sequentieanalyse van tot expressie gebrachte transcripten.

• Genklonering en expressiestudies : Biedt een DNA-template voor klonerings- en functionele genexpressie-experimenten.

• Analyse van transcriptisovormen en alternatieve splicing: Maakt onderzoek mogelijk naar transcriptisovormen en patronen van alternatieve splicing.

• Transcriptoom- en functioneel genoomonderzoek : Passend geconstrueerde cDNA-bibliotheken en collecties van volledige cDNA’s ondersteunen de karakterisering van het transcriptoom, genontdekking, genoomannotatie en functionele genomica.